ProteoWizard
Class Index
A | B | C | D | E | F | G | H | I | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z
  A  
DefaultTabHandler (pwiz::utility)   Modification (pwiz::identdata)   ProteomeData (pwiz::proteome)   SpectrumIterator (pwiz::msdata)   
DelimReader (pwiz::identdata)   Modification (pwiz::tradata)   ProteomeDataFile (pwiz::proteome)   SpectrumList (pwiz::msdata)   
Activation (pwiz::msdata)   DelimWriter (pwiz::identdata)   Modification (pwiz::proteome)   Provider (pwiz::identdata)   SpectrumList_ABI (pwiz::msdata::detail)   
AdaptedErrorDerivative (pwiz::frequency::DerivativeTest)   Diff (pwiz::data)   ModificationInfo (pwiz::data::pepxml)   Publication (pwiz::tradata)   SpectrumList_ABI_T2D (pwiz::msdata::detail)   
AdaptedErrorFunction (pwiz::frequency::DerivativeTest)   DiffConfig (pwiz::msdata)   ModificationList (pwiz::proteome)   
  Q  
SpectrumList_Agilent (pwiz::msdata::detail)   
AlternativeProtein (pwiz::data::pepxml)   DiffConfig (pwiz::identdata)   ModificationMap (pwiz::proteome)   SpectrumList_Bruker (pwiz::msdata::detail)   
AmbiguousResidue (pwiz::identdata)   DiffConfig (pwiz::tradata)   mru_list (pwiz::util)   Q3RatioResult (pwiz::data::pepxml)   SpectrumList_BTDX (pwiz::msdata)   
AminoAcidModification (pwiz::data::pepxml)   DiffConfig (pwiz::proteome)   MS2Deisotoper (pwiz::analysis)   
  R  
SpectrumList_ChargeStateCalculator (pwiz::analysis)   
AnalysisCollection (pwiz::identdata)   DigestedPeptide (pwiz::proteome)   MS2NoiseFilter (pwiz::analysis)   SpectrumList_Filter (pwiz::analysis)   
AnalysisData (pwiz::identdata)   DigestedPeptideLessThan   MSData (pwiz::msdata)   random_access_compressed_ifstream (pwiz::util)   SpectrumList_FilterPredicate_ActivationType (pwiz::analysis)   
AnalysisProtocolCollection (pwiz::identdata)   Digestion (pwiz::proteome)   MSDataAnalyzer (pwiz::analysis)   RawMassDatum   SpectrumList_FilterPredicate_AnalyzerType (pwiz::analysis)   
AnalysisResult (pwiz::data::pepxml)   DistributionPoint (pwiz::data::pepxml)   MSDataAnalyzerContainer (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::identdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ChargeStateSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSampleCollection (pwiz::identdata)   KernelTraits::Dummy (pwiz::math::MatchedFilter)   MSDataAnalyzerDriver (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_DefaultArrayLengthSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSoftware (pwiz::identdata)   
  E  
MSDataCache (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::tradata)   SpectrumList_FilterPredicate_IndexSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSummary (pwiz::data::pepxml)   MSDataFile (pwiz::msdata)   Reader (pwiz::proteome)   SpectrumList_FilterPredicate_MSLevelSet (pwiz::analysis)   
AnalysisTimestamp (pwiz::data::pepxml)   Element (pwiz::chemistry::detail)   MSDataMerger (pwiz::msdata)   Reader1   SpectrumList_FilterPredicate_MzPresent (pwiz::analysis)   
analyzer_strings (pwiz::analysis)   Index::Entry (pwiz::data)   MSDataWithSettableVersion   Reader2   SpectrumList_FilterPredicate_Polarity (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< MetadataReporter > (pwiz::analysis)   EnzymaticSearchConstraint (pwiz::data::pepxml)   MSIHandler (pwiz::utility)   Reader_ABI (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_PrecursorMzSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionSIC > (pwiz::analysis)   Enzyme (pwiz::identdata)   MSInspectRecordBuilder (pwiz::peptideid)   Reader_ABI_T2D (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanEventSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionSlice > (pwiz::analysis)   EnzymePtr_missedCleavages   MSLevelSorter   Reader_Agilent (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionTIC > (pwiz::analysis)   EnzymePtr_specificity   MSMSPipelineAnalysis (pwiz::data::pepxml)   Reader_Bruker (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RunSummary > (pwiz::analysis)   Enzymes (pwiz::identdata)   MSMSRunSummary (pwiz::data::pepxml)   Reader_BTDX (pwiz::msdata)   SpectrumList_MetadataFixer (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< SpectrumBinaryData > (pwiz::analysis)   ParametrizedFunction::ErrorFunction (pwiz::frequency)   MSnHeader (pwiz::msdata)   Reader_FASTA (pwiz::proteome)   SpectrumList_MGF (pwiz::msdata)   
analyzer_strings< SpectrumTable > (pwiz::analysis)   ErrorPoint (pwiz::data::pepxml)   MyBase   Reader_MGF (pwiz::msdata)   SpectrumList_MSn (pwiz::msdata)   
AnotherRootHandler   EvenMS2Predicate   MyPred   Reader_MSn (pwiz::msdata)   SpectrumList_mzML (pwiz::msdata)   
Handler::Attributes::attribute (pwiz::minimxml::SAXParser)   EvenPredicate   MyWrapper   Reader_mz5 (pwiz::msdata)   SpectrumList_MZWindow (pwiz::analysis)   
XMLWriter::Attributes (pwiz::minimxml)   EvenRequester   MZIntensityPair (pwiz::msdata)   Reader_mzML (pwiz::msdata)   SpectrumList_mzXML (pwiz::msdata)   
Handler::Attributes (pwiz::minimxml::SAXParser)   Evidence (pwiz::tradata)   mzrtEqual   Reader_mzXML (pwiz::msdata)   SpectrumList_PeakFilter (pwiz::analysis)   
  B  
ExtendedReaderList (pwiz::msdata)   MZRTField (pwiz::analysis)   Reader_Thermo (pwiz::msdata)   SpectrumList_PeakPicker (pwiz::analysis)   
ExtraZeroSamplesFilter (pwiz::analysis)   MZTolerance (pwiz::chemistry)   Reader_Waters (pwiz::msdata)   SpectrumList_PrecursorRecalculator (pwiz::analysis)   
BadListener   
  F  
  N  
Reader2::ReaderConfig   SpectrumList_PrecursorRefine (pwiz::analysis)   
BaseDiffConfig (pwiz::data)   Reader1::ReaderConfig   SpectrumList_Smoother (pwiz::analysis)   
basic_charcounter (pwiz::minimxml)   Feature (pwiz::data::peakdata)   nativeID_less (pwiz::peptideid)   ReaderFail (pwiz::identdata)   SpectrumList_Sorter (pwiz::analysis)   
BibliographicReference (pwiz::identdata)   FeatureDetector (pwiz::analysis)   NestedHandler   ReaderFail (pwiz::tradata)   SpectrumList_SorterPredicate_ScanStartTime (pwiz::analysis)   
BinaryDataArray (pwiz::msdata)   FeatureDetectorPeakel (pwiz::analysis)   PeakFamilyDetectorFT::NoDataException (pwiz::analysis)   ReaderFail (pwiz::proteome)   SpectrumList_Thermo (pwiz::msdata::detail)   
BinaryDataEncoder (pwiz::msdata)   FeatureDetectorSimple (pwiz::analysis)   Noise (pwiz::analysis)   ReaderFail (pwiz::msdata)   SpectrumList_TitleMaker (pwiz::analysis)   
BinaryIndexStream (pwiz::data)   FeatureFile (pwiz::data::peakdata)   NoiseCalculator (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::proteome)   SpectrumList_Waters (pwiz::msdata::detail)   
  C  
FeatureModeler (pwiz::analysis)   NoiseCalculator_2Pass (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::identdata)   SpectrumList_ZeroSamplesFilter (pwiz::analysis)   
FeatureModeler_Gaussian (pwiz::analysis)   
  O  
ReaderList (pwiz::tradata)   SpectrumListBase (pwiz::msdata)   
CalibrationParameters (pwiz::data)   Fifth   ReaderList (pwiz::msdata)   SpectrumListCache (pwiz::msdata)   
CancelListener   FifthHandler   OBO (pwiz::data)   PeptideID::Record (pwiz::peptideid)   SpectrumListFactory (pwiz::analysis)   
CancelProgressCallback   FileContent (pwiz::msdata)   once_flag_proxy (pwiz::util)   IPIFASTADatabase::Record (pwiz::proteome)   SpectrumListSimple (pwiz::msdata)   
basic_charcounter::category (pwiz::minimxml)   FileDescription (pwiz::msdata)   OneMinusAbs   PepxmlRecordReader::record (pwiz::analysis)   SpectrumListWrapper (pwiz::msdata)   
CharIndexedVector (pwiz::util)   Filter (pwiz::identdata)   OrderedPair (pwiz::math)   MSIHandler::Record (pwiz::utility)   SpectrumQuery (pwiz::data::pepxml)   
CharIndexedVectorConstIterator (pwiz::util)   FilterWrapper   OrderedPairContainerRef (pwiz::math)   Record (pwiz::chemistry::Element::Info)   RegionAnalyzer::SpectrumStats (pwiz::analysis)   
CharIndexedVectorIterator (pwiz::util)   First   Organization (pwiz::identdata)   Record (pwiz::proteome::AminoAcid::Info)   SpectrumTable (pwiz::analysis)   
Chromatogram (pwiz::msdata)   FirstHandler   organization_p (pwiz::identdata)   RegexCVMap (pwiz::identdata)   Stats (pwiz::math)   
ChromatogramDataFilter (pwiz::analysis)   FlatRecordBuilder (pwiz::peptideid)   XMLWriter::OutputObserver (pwiz::minimxml)   RegionAnalyzer (pwiz::analysis)   RegionAnalyzer::Stats (pwiz::analysis)   
ChromatogramIdentity (pwiz::msdata)   Formula (pwiz::chemistry)   
  P  
RegionSIC (pwiz::analysis)   Handler::Status (pwiz::minimxml::SAXParser)   
ChromatogramList (pwiz::msdata)   FragmentArray (pwiz::identdata)   RegionSlice (pwiz::analysis)   StringMatchCVMap (pwiz::identdata)   
ChromatogramList_ABI (pwiz::msdata::detail)   Fragmentation (pwiz::proteome)   Parabola (pwiz::math)   RegionTIC (pwiz::analysis)   SubstitutionModification (pwiz::identdata)   
ChromatogramList_Agilent (pwiz::msdata::detail)   FrequencyData (pwiz::data)   ParamContainer (pwiz::data)   Residue (pwiz::identdata)   
  T  
ChromatogramList_Bruker (pwiz::msdata::detail)   FrequencyEstimator (pwiz::frequency)   Software::Parameter (pwiz::data::peakdata)   RetentionTime (pwiz::tradata)   
ChromatogramList_mzML (pwiz::msdata)   FrequencyEstimatorPhysicalModel (pwiz::frequency)   Parameter (pwiz::data::pepxml)   RocDataPoint (pwiz::data::pepxml)   TabHandler (pwiz::utility)   
ChromatogramList_Thermo (pwiz::msdata::detail)   FrequencyEstimatorSimple (pwiz::frequency)   ParameterEstimator (pwiz::frequency)   Root   TabReader (pwiz::utility)   
ChromatogramList_Waters (pwiz::msdata::detail)   FTSieve   ParametrizedCosine   RootHandler   TabularConfig (pwiz::analysis)   
ChromatogramListBase (pwiz::msdata)   
  G  
ParametrizedDerivativeSlice (pwiz::frequency::DerivativeTest)   RTMatches_Any (pwiz::analysis)   Target (pwiz::msdata)   
ChromatogramListSimple (pwiz::msdata)   ParametrizedFunction (pwiz::frequency)   RTMatches_Contains (pwiz::analysis)   Target (pwiz::tradata)   
ClickwrapPrompter (pwiz::util)   Goober   ParametrizedFunctionSlice (pwiz::frequency::DerivativeTest)   RTMatches_IsContainedIn (pwiz::analysis)   TargetList (pwiz::tradata)   
Image::Color (pwiz::util)   
  H  
ParamGroup (pwiz::data)   Run (pwiz::msdata)   Term (pwiz::data)   
Component (pwiz::msdata)   Peak (pwiz::data::peakdata)   RunSummary (pwiz::analysis)   TestAminoAcid   
ComponentList (pwiz::msdata)   Handler (pwiz::minimxml::SAXParser)   Peak (pwiz::analysis)   
  S  
TestChargeStateCalculator   
Compound (pwiz::tradata)   HandlerFeature (pwiz::data::peakdata)   PeakData (pwiz::data::peakdata)   TestData   
PeakFitter_Parabola::Config (pwiz::analysis)   HandlerPeak (pwiz::data::peakdata)   PeakDetector (pwiz::frequency)   Same (pwiz::data::diff_impl)   TestDatum   
PeakFinder_SNR::Config (pwiz::analysis)   HandlerPeakel (pwiz::data::peakdata)   PeakDetector (pwiz::analysis)   SameDeep (pwiz::data::diff_impl)   TestDeisotoper   
BinaryDataEncoder::Config (pwiz::msdata)   HasBinaryDataPredicate   PeakDetectorMatchedFilter (pwiz::frequency)   Sample (pwiz::msdata)   TestETDMassFilter   
PeakFamilyDetectorFT::Config (pwiz::analysis)   HasID (pwiz::data::diff_impl)   PeakDetectorNaive (pwiz::frequency)   Sample (pwiz::identdata)   TestFormula   
PeakelPicker_Basic::Config (pwiz::analysis)   
  I  
Peakel (pwiz::data::peakdata)   SampleDatum (pwiz::data)   TestFragmentation   
PeakelGrower_Proximity::Config (pwiz::analysis)   PeakelGrower (pwiz::analysis)   SampledData (pwiz::math::MatchedFilter)   TestInfo   
NoiseCalculator_2Pass::Config (pwiz::analysis)   id_p (pwiz::identdata)   PeakelGrower_Proximity (pwiz::analysis)   SampleEnzyme (pwiz::data::pepxml)   TestIterationListener   
Serializer_Text::Config (pwiz::identdata)   IdentData (pwiz::identdata)   PeakelPicker (pwiz::analysis)   SavitzkyGolaySmoother (pwiz::analysis)   TestIterationListener_WithCancel   
Serializer_protXML::Config (pwiz::identdata)   IdentDataFile (pwiz::identdata)   PeakelPicker_Basic (pwiz::analysis)   saxstring (pwiz::minimxml::SAXParser)   TestListener   
Serializer_pepXML::Config (pwiz::identdata)   Identifiable (pwiz::identdata)   PeakExtractor (pwiz::analysis)   Scan (pwiz::data::peakdata)   TestMetadataFixer   
FeatureDetectorPeakel::Config (pwiz::analysis)   IdentifiableParamContainer (pwiz::identdata)   PeakFamily (pwiz::data::peakdata)   Scan (pwiz::msdata)   TestModification   
Serializer_mzIdentML::Config (pwiz::identdata)   Image (pwiz::util)   PeakFamilyDetector (pwiz::analysis)   ScanList (pwiz::msdata)   TestModifiedPeptide   
Reader2::Config   Index (pwiz::data)   PeakFamilyDetectorFT (pwiz::analysis)   ScanSettings (pwiz::msdata)   TestMS2Denoise   
Reader1::Config   Index_mzML (pwiz::msdata)   PeakFinder (pwiz::analysis)   ScanWindow (pwiz::msdata)   TestOperator   
SpectrumTable::Config (pwiz::analysis)   SpectrumList_mzXML::index_not_found (pwiz::msdata)   PeakFinder_SNR (pwiz::analysis)   PeakDetectorMatchedFilter::Score (pwiz::frequency)   TestOutputObserver   
Reader::Config (pwiz::identdata)   IndexList (pwiz::proteome)   PeakFitter (pwiz::analysis)   SearchDatabase (pwiz::data::pepxml)   TestPair   
SpectrumBinaryData::Config (pwiz::analysis)   IndexList (pwiz::msdata)   PeakFitter_Parabola (pwiz::analysis)   SearchDatabase (pwiz::identdata)   TestPathmask   
RunSummary::Config (pwiz::analysis)   Inputs (pwiz::identdata)   Pep2MzIdent (pwiz::identdata)   SearchHit (pwiz::data::pepxml)   TestPathPredicate (pwiz::util)   
RegionTIC::Config (pwiz::analysis)   Instrument (pwiz::tradata)   Peptide (pwiz::identdata)   SearchModification (pwiz::identdata)   TestPeptide   
RegionSlice::Config (pwiz::analysis)   InstrumentConfiguration (pwiz::msdata)   Peptide (pwiz::tradata)   SearchResult (pwiz::data::pepxml)   TestReader   
RegionSIC::Config (pwiz::analysis)   IntegerSet (pwiz::util)   Peptide (pwiz::proteome)   SearchScore (pwiz::data::pepxml)   TestSpectrumInfo   
RegionAnalyzer::Config (pwiz::analysis)   Interpretation (pwiz::tradata)   PeptideEvidence (pwiz::identdata)   SearchSummary (pwiz::data::pepxml)   TestThresholder   
PepxmlRecordReader::Config (pwiz::analysis)   IntegerSet::Interval (pwiz::util)   PeptideHypothesis (pwiz::identdata)   Second   TextWriter (pwiz::identdata)   
MSDataCache::Config (pwiz::analysis)   IonType (pwiz::identdata)   PeptideID (pwiz::peptideid)   SecondHandler   TextWriter (pwiz::proteome)   
XMLWriter::Config (pwiz::minimxml)   IPIFASTADatabase (pwiz::proteome)   PeptideID_flat (pwiz::peptideid)   SelectedIndexPredicate   TextWriter (pwiz::tradata)   
IsotopeEnvelopeEstimator::Config (pwiz::chemistry)   Is_T2D_Directory   PeptideID_pepXml (pwiz::peptideid)   SelectedIon (pwiz::msdata)   TextWriter (pwiz::msdata)   
PeakDetectorMatchedFilter::Config (pwiz::frequency)   IsDirectory   PeptideIDMap (pwiz::peptideid)   seq_p (pwiz::identdata)   ThreadStatus   
FrequencyEstimatorPhysicalModel::Config (pwiz::frequency)   IsolationWindow (pwiz::msdata)   PeptideProphetResult (pwiz::data::pepxml)   sequence_p (pwiz::identdata)   ThresholdFilter (pwiz::analysis)   
Serializer_FASTA::Config (pwiz::proteome)   Isotope (pwiz::chemistry::detail)   PeptideProphetSummary (pwiz::data::pepxml)   SequenceCollection (pwiz::identdata)   TimeIntensityPair (pwiz::msdata)   
Reader_FASTA::Config (pwiz::proteome)   IsotopeCalculator (pwiz::chemistry)   PepxmlRecordReader (pwiz::analysis)   Serializer_FASTA (pwiz::proteome)   Timer (pwiz::util)   
Digestion::Config (pwiz::proteome)   IsotopeEnvelopeEstimator (pwiz::chemistry)   PepXMLSpecificity (pwiz::identdata)   Serializer_MGF (pwiz::msdata)   TraData (pwiz::tradata)   
SpectrumIterator::Config (pwiz::msdata)   IsotopeTable (pwiz::chemistry)   Person (pwiz::identdata)   Serializer_MSn (pwiz::msdata)   TraDataFile (pwiz::tradata)   
PrecursorRecalculatorDefault::Config (pwiz::analysis)   IsRawData   person_p (pwiz::identdata)   Serializer_mzIdentML (pwiz::identdata)   Transition (pwiz::tradata)   
Serializer_mzXML::Config (pwiz::msdata)   IsRawFile   Image::Point (pwiz::util)   Serializer_mzML (pwiz::msdata)   TranslationTable (pwiz::identdata)   
Serializer_mzML::Config (pwiz::msdata)   IsWiffFile   Precursor (pwiz::tradata)   Serializer_mzXML (pwiz::msdata)   TruncatedLorentzian (pwiz::frequency)   
PrecursorMassFilter::Config (pwiz::analysis)   IterationListener (pwiz::util)   Precursor (pwiz::msdata)   Serializer_pepXML (pwiz::identdata)   TruncatedLorentzianEstimator (pwiz::frequency)   
Reader::Config (pwiz::msdata)   IterationListenerRegistry (pwiz::util)   SpectrumList_PrecursorRefine::PrecursorInfo (pwiz::analysis)   Serializer_protXML (pwiz::identdata)   TruncatedLorentzianParameters (pwiz::frequency)   
MS2NoiseFilter::Config (pwiz::analysis)   PeptideID::Iterator (pwiz::peptideid)   PrecursorRecalculator::PrecursorInfo (pwiz::analysis)   Serializer_Text (pwiz::identdata)   
  U  
MS2Deisotoper::Config (pwiz::analysis)   IntegerSet::Iterator (pwiz::util)   SpectrumInfo::PrecursorInfo (pwiz::msdata)   Serializer_traML (pwiz::tradata)   
Configuration (pwiz::tradata)   PeptideID::IteratorInternal (pwiz::peptideid)   PrecursorMassFilter (pwiz::analysis)   SetRetentionTime   IterationListener::UpdateMessage (pwiz::util)   
Digestion::const_iterator (pwiz::proteome)   
  K  
PrecursorRecalculator (pwiz::analysis)   SHA1_ostream (pwiz::util)   usage_exception (pwiz::util)   
Contact (pwiz::msdata)   PrecursorRecalculatorDefault (pwiz::analysis)   SHA1_WORKSPACE_BLOCK   user_error (pwiz::util)   
Contact (pwiz::identdata)   KernelTraits (pwiz::math::MatchedFilter)   SpectrumList_Sorter::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1Calculator (pwiz::util)   UserParam (pwiz::data)   
Contact (pwiz::tradata)   KernelTraitsBase (pwiz::math::MatchedFilter)   SpectrumList_Filter::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1Filter (pwiz::util)   
  V  
ContactRole (pwiz::identdata)   KernelTraitsBase< Y(*)(X)> (pwiz::math::MatchedFilter)   ProteinList_Filter::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1OutputObserver (pwiz::msdata)   
Correlation (pwiz::math::MatchedFilter)   
  L  
ProteinList_DecoyGenerator::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1SymmetricFilter (pwiz::util)   Validation (pwiz::tradata)   
CSHA1   Prediction (pwiz::tradata)   shared_map (pwiz::util)   VectorFunction (pwiz::frequency::DerivativeTest)   
CustomPair   LegacyAdapter_Instrument (pwiz::msdata)   PrintAttribute   SpectrumIterator::Sieve (pwiz::msdata)   VectorTabHandler (pwiz::utility)   
CV (pwiz::cv)   LegacyAdapter_Software (pwiz::msdata)   PrintEventHandler   Simple   Version (pwiz)   
CVIDMatchCVMap (pwiz::identdata)   LinearLeastSquares (pwiz::math)   ProcessingMethod (pwiz::msdata)   SimpleAnalyzer   Version (pwiz::analysis)   
CVMap (pwiz::identdata)   LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_LU > (pwiz::math)   Product (pwiz::tradata)   SimpleProgressCallback   Version (pwiz::msdata)   
CVParam (pwiz::data)   LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_QR > (pwiz::math)   Product (pwiz::msdata)   Smoother (pwiz::analysis)   Version (pwiz::tradata)   
CVParamIs (pwiz::data)   LinearSolver (pwiz::math)   ProductSpace (pwiz::math::MatchedFilter)   Software (pwiz::msdata)   Version (pwiz::proteome)   
CVParamIsChildOf (pwiz::data)   LinearSolver< LinearSolverType_LU > (pwiz::math)   MSDataAnalyzerDriver::ProgressCallback (pwiz::analysis)   Software (pwiz::data::peakdata)   Version (pwiz::identdata)   
CVTermInfo (pwiz::cv)   LinearSolver< LinearSolverType_QR > (pwiz::math)   Protein (pwiz::tradata)   Software (pwiz::tradata)   virtual_map (pwiz::util)   
CVTranslator (pwiz::data)   LocalMaximumPeakDetector (pwiz::analysis)   Protein (pwiz::proteome)   software_p (pwiz::identdata)   
  W  
  D  
PeptideID::Location (pwiz::peptideid)   ProteinAmbiguityGroup (pwiz::identdata)   SourceFile (pwiz::msdata)   
location_less (pwiz::peptideid)   ProteinDetection (pwiz::identdata)   SourceFile (pwiz::identdata)   WhittakerSmoother (pwiz::analysis)   
DatabaseTranslation (pwiz::identdata)   
  M  
ProteinDetectionHypothesis (pwiz::identdata)   Specificity (pwiz::data::pepxml)   ProteomeDataFile::WriteConfig (pwiz::proteome)   
DataCollection (pwiz::identdata)   ProteinDetectionList (pwiz::identdata)   SpectraData (pwiz::identdata)   IdentDataFile::WriteConfig (pwiz::identdata)   
DataFilter (pwiz::data::pepxml)   MagnitudeLorentzian (pwiz::frequency)   ProteinDetectionProtocol (pwiz::identdata)   Spectrum (pwiz::msdata)   TraDataFile::WriteConfig (pwiz::tradata)   
MSDataAnalyzer::DataInfo (pwiz::analysis)   MascotReader (pwiz::identdata)   ProteinList (pwiz::proteome)   SpectrumBinaryData (pwiz::analysis)   MSDataFile::WriteConfig (pwiz::msdata)   
DataProcessing (pwiz::msdata)   MassAbundance (pwiz::chemistry)   ProteinList_DecoyGenerator (pwiz::analysis)   SpectrumDataFilter (pwiz::analysis)   WriteCVParam   
DatasetDerivation (pwiz::data::pepxml)   MassTable (pwiz::identdata)   ProteinList_DecoyGeneratorPredicate_Reversed (pwiz::analysis)   SpectrumIdentification (pwiz::identdata)   
  X  
Datum   Match (pwiz::data::pepxml)   ProteinList_DecoyGeneratorPredicate_Shuffled (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationItem (pwiz::identdata)   
DBSequence (pwiz::identdata)   MatchData (pwiz::data::pepxml)   ProteinList_Filter (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationList (pwiz::identdata)   XMLWriter (pwiz::minimxml)   
dbsequence_p (pwiz::identdata)   Measure (pwiz::identdata)   ProteinList_FilterPredicate_IdSet (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationProtocol (pwiz::identdata)   
  Z  
DefaultArrayLengthSorter   MemoryIndex (pwiz::data)   ProteinList_FilterPredicate_IndexSet (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationResult (pwiz::identdata)   
DefaultReaderList (pwiz::msdata)   MemoryMRUCache (pwiz::msdata)   ProteinListCache (pwiz::proteome)   SpectrumIdentity (pwiz::msdata)   ZeroSampleFiller (pwiz::analysis)   
DefaultReaderList (pwiz::identdata)   MetadataReporter (pwiz::analysis)   ProteinListFactory (pwiz::analysis)   SpectrumIdentityFromMzXML (pwiz::msdata)   
DefaultReaderList (pwiz::tradata)   MixtureModel (pwiz::data::pepxml)   ProteinListSimple (pwiz::proteome)   SpectrumIdentityFromXML (pwiz::msdata)   
DefaultReaderList (pwiz::proteome)   ModAminoAcidMass (pwiz::data::pepxml)   ProteinListWrapper (pwiz::proteome)   SpectrumInfo (pwiz::msdata)   
A | B | C | D | E | F | G | H | I | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Z